Nous nous trouvons dans l'univers fantastique de Möbius, un monde qui est peuplé par des hybrides, des humains, des machines intelligentes et bien d'autres créatures incroyables. C'est dans ce monde où vit le célèbre Sonic the hedgehog et ses amis qui sauvent leur planète face aux armées du vil savant fou, le Dr. Eggman. La suite de notre histoire se passe juste après les aventures contre Shadow, Silver et Blaze. Nos chers amis à fourrure ont enfin du repos après avoir sauvé la planète. Ils ont pris des vacances bien méritées. Möbius s'est reconstruit de nouveau petit à petit et les habitants purent enfin vivre dans le calme et se préoccuper à leur occupation habituelle.Du moins jusqu'à ce qu'une brèche spatio-temporelle s'ouvre et accueille une nouvelle menace, l'AntiSonic qui brisa la Master Emerald.Une nouvelle course à la recherche des joyaux de puissance est lancée. À vous de partir à l'aventure et de choisir votre camp !